Table 4

In vitro evolution experiments


40
 41
 43
 122
 184
 200
 210
 211
 214
 215
 219
 245
 248
 272
 277
 293
 297

HXB2
 E
 M
 K
 E
 M
 T
 L
 R
 L
 T
 K
 V
 E
 P
 R
 I
 E
M41L+T215Y
 start
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 L
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 Y
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experiment A
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experiment B
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experiment C
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experiment D
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M41L+T215Y+E40F
 start
 F
 L
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 Y
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experiment A
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experiment B
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experiment C
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experiment D
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Pat A
 start
 F
 L
 E
 K
 V
 I
 W
 K
 F
 Y
 T
 T
 D
 A
 K
 V
 H

experiment A
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experiment B
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experiment C
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experiment D
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Pat A-WT40
 start
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 L
 E
 K
 V
 I
 W
 K
 F
 Y
 T
 T
 D
 A
 K
 V
 H

experiment A
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experiment B
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experiment C
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experiment D
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K43E only
 start
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 E
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experiment A
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 T/I
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experiment B
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experiment C
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experiment D
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M41L+T215Y+K43E
 start
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 L
 E
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 Y
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experiment A
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experiment B
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experiment C
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experiment D
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M41L+T215Y+ E40F+K43E
 start
 F
 L
 E
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 Y
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experiment A
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experiment B
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experiment C
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experiment D
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Pat A-WT43
 start
 F
 L
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 K
 V
 I
 W
 K
 F
 Y
 T
 T
 D
 A
 K
 V
 H

experiment A
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experiment B
 F/L
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experiment C
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experiment D
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Shown are all amino acid changes present at start of the experiment compared to wild type (HXB2) and after 10 passages compared to baseline. All evolution experiments were performed in four independent experiments (A-D).

Huigen et al. Retrovirology 2008 5:20   doi:10.1186/1742-4690-5-20